Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYT9Q86SS6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYT9Q86SS6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms