Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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RFPL4BQ6ZWI9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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RFPL4BQ6ZWI9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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RFPL4BQ6ZWI9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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RFPL4BQ6ZWI9 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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RFPL4BQ6ZWI9 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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RFPL4BQ6ZWI9 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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RFPL4BQ6ZWI9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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RFPL4BQ6ZWI9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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RFPL4BQ6ZWI9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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RFPL4BQ6ZWI9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RFPL4BQ6ZWI9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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