Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT16

SLC18B1, MFS-type transporter SLC18B1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18B1Q6NT16 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC18B1Q6NT16 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms