Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LRRC8EQ6NSJ5 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms