Protein–RNA interactions for Protein: Q6B0B8

TIGD3, Tigger transposable element-derived protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD3Q6B0B8 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIGD3Q6B0B8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIGD3Q6B0B8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIGD3Q6B0B8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIGD3Q6B0B8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIGD3Q6B0B8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIGD3Q6B0B8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TIGD3Q6B0B8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIGD3Q6B0B8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIGD3Q6B0B8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIGD3Q6B0B8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIGD3Q6B0B8 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIGD3Q6B0B8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIGD3Q6B0B8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIGD3Q6B0B8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIGD3Q6B0B8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIGD3Q6B0B8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIGD3Q6B0B8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIGD3Q6B0B8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIGD3Q6B0B8 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIGD3Q6B0B8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIGD3Q6B0B8 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TIGD3Q6B0B8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIGD3Q6B0B8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIGD3Q6B0B8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIGD3Q6B0B8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIGD3Q6B0B8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIGD3Q6B0B8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIGD3Q6B0B8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIGD3Q6B0B8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIGD3Q6B0B8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIGD3Q6B0B8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TIGD3Q6B0B8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TIGD3Q6B0B8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms