Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF123Q5XPI4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF123Q5XPI4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms