Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT28

FAM27B, Protein FAM27A/B/C, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27BQ5VT28 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM27BQ5VT28 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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