Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NBPF8Q3BBV2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NBPF8Q3BBV2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms