Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NBPF1Q3BBV0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms