Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CSPP1Q1MSJ5 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSPP1Q1MSJ5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms