Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VPS72Q15906 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS72Q15906 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
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