Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NPTX1Q15818 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NPTX1Q15818 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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