Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NWD1Q149M9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NWD1Q149M9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NWD1Q149M9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NWD1Q149M9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NWD1Q149M9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NWD1Q149M9 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NWD1Q149M9 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NWD1Q149M9 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NWD1Q149M9 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NWD1Q149M9 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NWD1Q149M9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NWD1Q149M9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NWD1Q149M9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NWD1Q149M9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
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