Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RFTN1Q14699 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RFTN1Q14699 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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