Protein–RNA interactions for Protein: Q14432

PDE3A, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase A, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3AQ14432 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PDE3AQ14432 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDE3AQ14432 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDE3AQ14432 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDE3AQ14432 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3AQ14432 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3AQ14432 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3AQ14432 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3AQ14432 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3AQ14432 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3AQ14432 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3AQ14432 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3AQ14432 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3AQ14432 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3AQ14432 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3AQ14432 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3AQ14432 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3AQ14432 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3AQ14432 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDE3AQ14432 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms