Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COL9A3Q14050 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms