Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CKAP5Q14008 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CKAP5Q14008 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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