Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APOFQ13790 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
APOFQ13790 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
APOFQ13790 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOFQ13790 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOFQ13790 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOFQ13790 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOFQ13790 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOFQ13790 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOFQ13790 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOFQ13790 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOFQ13790 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOFQ13790 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOFQ13790 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOFQ13790 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOFQ13790 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOFQ13790 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOFQ13790 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOFQ13790 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOFQ13790 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOFQ13790 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOFQ13790 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOFQ13790 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOFQ13790 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
APOFQ13790 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOFQ13790 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOFQ13790 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOFQ13790 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOFQ13790 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOFQ13790 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOFQ13790 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOFQ13790 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOFQ13790 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOFQ13790 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOFQ13790 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APOFQ13790 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
APOFQ13790 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
APOFQ13790 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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