Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 PSMG2-210ENST00000590217 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MKRN4PQ13434 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
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MKRN4PQ13434 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
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MKRN4PQ13434 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MKRN4PQ13434 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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