Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
IKZF1Q13422 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms