Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HSPB3Q12988 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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