Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BNIP3Q12983 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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BNIP3Q12983 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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BNIP3Q12983 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BNIP3Q12983 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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