Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms