Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLFN5Q08AF3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLFN5Q08AF3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms