Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TGM3Q08188 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms