Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHRNDQ07001 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHRNDQ07001 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHRNDQ07001 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHRNDQ07001 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CHRNDQ07001 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNDQ07001 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNDQ07001 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNDQ07001 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNDQ07001 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNDQ07001 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNDQ07001 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNDQ07001 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNDQ07001 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNDQ07001 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNDQ07001 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CHRNDQ07001 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms