Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms