Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTDSPL2Q05D32 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms