Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GRIN1Q05586 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GRIN1Q05586 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms