Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACVR1Q04771 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms