Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POU5F1Q01860 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms