Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BEX3Q00994 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms