Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CACNA1BQ00975 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms