Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDK6Q00534 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms