Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXC5Q00444 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms