Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms