Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX3P78415 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX3P78415 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX3P78415 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX3P78415 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX3P78415 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX3P78415 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX3P78415 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX3P78415 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX3P78415 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX3P78415 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX3P78415 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX3P78415 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX3P78415 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX3P78415 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX3P78415 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX3P78415 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX3P78415 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX3P78415 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX3P78415 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX3P78415 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX3P78415 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX3P78415 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX3P78415 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX3P78415 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX3P78415 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX3P78415 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX3P78415 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX3P78415 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX3P78415 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX3P78415 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX3P78415 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX3P78415 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX3P78415 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX3P78415 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX3P78415 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX3P78415 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX3P78415 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX3P78415 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX3P78415 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX3P78415 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX3P78415 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX3P78415 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX3P78415 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX3P78415 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX3P78415 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX3P78415 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX3P78415 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX3P78415 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX3P78415 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX3P78415 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX3P78415 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX3P78415 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX3P78415 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX3P78415 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX3P78415 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX3P78415 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX3P78415 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX3P78415 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX3P78415 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX3P78415 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX3P78415 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX3P78415 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX3P78415 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX3P78415 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX3P78415 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX3P78415 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX3P78415 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX3P78415 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX3P78415 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX3P78415 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX3P78415 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX3P78415 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX3P78415 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX3P78415 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
IRX3P78415 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
IRX3P78415 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
IRX3P78415 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
IRX3P78415 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
IRX3P78415 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
IRX3P78415 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
IRX3P78415 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
IRX3P78415 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX3P78415 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX3P78415 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX3P78415 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX3P78415 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX3P78415 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX3P78415 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX3P78415 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX3P78415 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX3P78415 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX3P78415 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX3P78415 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX3P78415 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX3P78415 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX3P78415 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX3P78415 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX3P78415 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX3P78415 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms