Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SNRPNP63162 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms