Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP7P55210 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP7P55210 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP7P55210 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP7P55210 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP7P55210 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP7P55210 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP7P55210 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP7P55210 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP7P55210 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP7P55210 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP7P55210 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP7P55210 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP7P55210 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP7P55210 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP7P55210 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP7P55210 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP7P55210 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP7P55210 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP7P55210 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP7P55210 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP7P55210 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP7P55210 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CASP7P55210 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP7P55210 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CASP7P55210 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP7P55210 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP7P55210 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP7P55210 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CASP7P55210 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP7P55210 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CASP7P55210 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP7P55210 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP7P55210 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP7P55210 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CASP7P55210 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP7P55210 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP7P55210 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP7P55210 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP7P55210 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CASP7P55210 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CASP7P55210 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP7P55210 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP7P55210 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP7P55210 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP7P55210 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CASP7P55210 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP7P55210 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP7P55210 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP7P55210 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CASP7P55210 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CASP7P55210 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP7P55210 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP7P55210 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP7P55210 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP7P55210 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP7P55210 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP7P55210 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP7P55210 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP7P55210 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP7P55210 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP7P55210 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP7P55210 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP7P55210 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP7P55210 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP7P55210 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP7P55210 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP7P55210 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP7P55210 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP7P55210 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP7P55210 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP7P55210 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP7P55210 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CASP7P55210 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP7P55210 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP7P55210 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP7P55210 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP7P55210 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP7P55210 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP7P55210 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP7P55210 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CASP7P55210 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP7P55210 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP7P55210 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP7P55210 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP7P55210 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP7P55210 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP7P55210 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP7P55210 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP7P55210 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CASP7P55210 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CASP7P55210 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP7P55210 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP7P55210 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP7P55210 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP7P55210 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CASP7P55210 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CASP7P55210 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP7P55210 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CASP7P55210 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms