Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EFNA3P52797 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms