Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SMARCA2P51531 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms