Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL1P40616 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL1P40616 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL1P40616 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL1P40616 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL1P40616 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL1P40616 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL1P40616 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL1P40616 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL1P40616 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL1P40616 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL1P40616 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL1P40616 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL1P40616 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL1P40616 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL1P40616 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL1P40616 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL1P40616 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL1P40616 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL1P40616 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL1P40616 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL1P40616 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL1P40616 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL1P40616 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL1P40616 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL1P40616 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL1P40616 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL1P40616 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL1P40616 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL1P40616 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL1P40616 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL1P40616 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL1P40616 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL1P40616 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL1P40616 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ARL1P40616 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARL1P40616 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ARL1P40616 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ARL1P40616 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL1P40616 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL1P40616 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL1P40616 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL1P40616 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL1P40616 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL1P40616 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL1P40616 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL1P40616 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL1P40616 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL1P40616 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL1P40616 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL1P40616 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL1P40616 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL1P40616 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL1P40616 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL1P40616 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL1P40616 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL1P40616 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL1P40616 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL1P40616 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL1P40616 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL1P40616 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL1P40616 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL1P40616 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL1P40616 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ARL1P40616 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms