Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ATP5C1P36542 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms