Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
THBS4P35443 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
THBS4P35443 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
THBS4P35443 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
THBS4P35443 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
THBS4P35443 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
THBS4P35443 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
THBS4P35443 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
THBS4P35443 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
THBS4P35443 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
THBS4P35443 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
THBS4P35443 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
THBS4P35443 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
THBS4P35443 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
THBS4P35443 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
THBS4P35443 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
THBS4P35443 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
THBS4P35443 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
THBS4P35443 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
THBS4P35443 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
THBS4P35443 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
THBS4P35443 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
THBS4P35443 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
THBS4P35443 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
THBS4P35443 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
THBS4P35443 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
THBS4P35443 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
THBS4P35443 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
THBS4P35443 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
THBS4P35443 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
THBS4P35443 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
THBS4P35443 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
THBS4P35443 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
THBS4P35443 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
THBS4P35443 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
THBS4P35443 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms