Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ABCC1P33527 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ABCC1P33527 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms