Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC8A1P32418 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms