Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPREP23469 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPREP23469 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPREP23469 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPREP23469 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPREP23469 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPREP23469 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPREP23469 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPREP23469 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPREP23469 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPREP23469 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPREP23469 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPREP23469 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPREP23469 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPREP23469 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPREP23469 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPREP23469 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPREP23469 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPREP23469 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPREP23469 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPREP23469 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPREP23469 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPREP23469 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPREP23469 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPREP23469 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPREP23469 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPREP23469 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPREP23469 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPREP23469 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPREP23469 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPREP23469 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPREP23469 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPREP23469 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPREP23469 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPREP23469 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPREP23469 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPREP23469 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPREP23469 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPREP23469 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPREP23469 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPREP23469 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPREP23469 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPREP23469 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPREP23469 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPREP23469 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPREP23469 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPREP23469 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPREP23469 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPREP23469 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPREP23469 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPREP23469 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPREP23469 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPREP23469 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPREP23469 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPREP23469 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPREP23469 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPREP23469 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPREP23469 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPREP23469 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPREP23469 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPREP23469 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPREP23469 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPREP23469 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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