Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PTPRBP23467 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRBP23467 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRBP23467 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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