Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CALB2P22676 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CALB2P22676 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CALB2P22676 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CALB2P22676 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CALB2P22676 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CALB2P22676 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CALB2P22676 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALB2P22676 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALB2P22676 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALB2P22676 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CALB2P22676 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALB2P22676 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALB2P22676 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALB2P22676 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALB2P22676 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALB2P22676 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALB2P22676 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALB2P22676 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALB2P22676 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CALB2P22676 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALB2P22676 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALB2P22676 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALB2P22676 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CALB2P22676 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms