Protein–RNA interactions for Protein: P0DP24

CALM2, Calmodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM2P0DP24 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALM2P0DP24 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms